情景一
这个样本CMV检出序列多条,到底有没有致病意义?
耶氏肺孢子菌检出多条,同时EBV条,还要不要考虑病毒感染呢?
你看,这个患者EBV、CMV、HSV都检出几条序列,临床也是很纠结啊!
最近送的这几例移植患者都检出了JC多瘤病毒和细环病毒,这两个病毒有没有致病性呢?
情景二
对部分华大样本做大数据分析,在调取的千份样本中,以EBV、CMV、细环病毒、BK多瘤病毒、JC多瘤病毒为关键词搜索,发现有9.8%、8.4%、3.5%、1%、0.7%的样本分别检出对应病毒,检出序列数从几条到几千条不等,而且这些病毒常二三混合检出。
可以看到,这些病毒在感染患者的样本中检出较为常见,但其致病性如何?临床该如何考虑其检出意义呢?(由于临床数据缺乏、暂不考虑这些样本与临床的一致性以及该技术的敏感性和特异性等问题,只用做通过文献探讨其致病意义)
在mNGS的临床应用实践中,我们常常了解到临床关于上述病毒致病性的疑惑。在提供检测报告的同时,我们也希望能够提供尽可能多的资料协助临床做出综合诊断。
在医院邱海波教授的启发下,本期我们分享一篇年发表在《PLOSONE》杂志上关于败血症患者中多种潜伏病毒再激活的文章。该文章首次系统性